儿童是一个特殊人群，安全有效的用药，对儿童的健康成长至关重要。儿童用药应根据其年龄，病种，病情和身体状况慎重选择药物，尤其需要严格掌握药物适应症，用药剂量，禁忌症等。
合理选药首先必须有明确诊断，没有明确诊断不可能对因治疗，对症下药。选药原则是尽可能选择疗效确切，药物的药理学，药动学，毒副作用都比较明确的药物，不要选择那些在药品说明书上写的毒副作用不明的药物(毒副作用不明，不代表没有毒副作用，而是没有做过系统性的研究，这样的药物不安全);另外尽可能选择一种药物，单一成分的药物，药物越多，成分越复杂，用药风险就越大。
儿童最常见的疾病就是上呼吸道感染，腹泻，皮肤过敏等。对于上呼吸道感染，不要一见发烧，就用抗菌药物，上呼吸道感染是由病毒感染引起一般情况是没必要使用抗菌素的，除非上呼吸道感染继发细菌感染，有明确的细菌感染指针，才使用抗菌药。即使是婴幼儿感染性腹泻，60%以上也是病毒感染引起，此时使用抗菌素也是没用的。
儿童应该避免使用氨基糖苷类抗菌药[如庆大霉素，阿米卡星，依替米星]，喹诺酮类抗菌药(如xx沙星)，四环素类(如四环素)。另外要慎重使用糖皮质激素(如地塞米松)，许多患儿感冒发烧后，家长心情急切，急着退热，有的医生可能会给打地塞米松，其实这是不对的，经常使用糖皮质激素有抑制免疫作用，同时也有抑制生长发育，抑制骨骼生长的副作用。糖皮质激素使用指南指出，糖皮质激素不应该以单纯退热为目的使用，只有在大于40.5℃高烧伴明显中毒症状或中毒休克时，才是最佳用药指针。
儿童由于肝肾功能发育不全，用药剂量稍有偏大就可能引起明显的不良反应或中毒反应。婴幼儿并不是成人的缩小版，所以用药剂量也不是根据成人剂量按比例进行减少。一般来说根据体表面积进行计算，更精确也更为合理。即小儿剂量＝成人剂量x小儿体表面积(㎡)/1.73㎡，小儿体表面积＝体重x0.035+0.1。
