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导 读
国际顶尖学术期刊 《Cell》及其子刊公布了“癌症和肿瘤基因图谱”（TCGA）的“升级版”——泛癌症图谱（PanCancer Atlas）的研究结果，相关结果以二十几篇高水平论文呈现，美国国家卫生研究院资助的科学家团队完成大规模癌症基因组图谱绘制，他们根据基因变异和表达的相似性，提出可以按照分子类型给癌症进行“归类”。研究人员认为，这将为癌症诊断和治疗提供新思路。
早在十几年前就已开始的一项大规模研究工作 “PanCancer Atlas” 近日已全面完成，它为研究人员和临床医生提供了一种根据其基因组和分子特征全面了解癌症的新方法。
PanCancer Atlas范围非常广，涵盖了国际顶尖学术期刊《Cell》及其子刊所发表的二十多篇科学论文。它代表癌症基因组图谱（TCGA）工作中的一个巨大里程碑。癌症基因组图谱（The Cancer Genome Atlas，TCGA）早已为全世界广为知晓，这项计划于2005年提出，旨在通过基因组学分析技术，将人类全部癌症的基因组变异图谱绘制出来，从而更好地了解癌症发生和发展的机制。
该项目由国立卫生研究院（NIH）的两个研究机构同时赞助，即国家癌症研究所（NCI）和国家人类基因组研究所。
全美超过二十多个研究机构的150多位研究人员参与了这项耗资3亿美元的项目。“这个项目，是十多年开创性工作的结晶。”美国国立卫生研究院院长弗朗西斯科林斯博士说。
从不同的角度看癌症
癌症是一种疾病，当细胞由于其DNA的错误编码开始失控时，就会出现这种疾病。传统的癌症分类方法是根据它在体内的起始位置 - 如乳腺癌，前列腺癌或胃癌。
PanCancer Atlas的这项工作是2012年在加利福尼亚圣克鲁斯举行的一次会议上由Pan-Cancer Initiative发起的。
那时，科学家们已经注意到一些关于癌症的有趣特征，使他们对疾病分类的传统方式产生质疑。一个有趣的特征是，尽管癌细胞开始于身体的不同部位，但有一些癌症在分子水平上是相似的。另一个有趣的特征是，在同一组织中开始的癌症在分子水平上可能非常不同，具有不同的“基因组谱”。
对研究人员&临床医生的影响
这些早期的分子形态促使研究人员调查每种癌症基因组中的变化——DNA的完整组合——可能会驱动某种疾病。
PanCancer Atlas是努力调查后的结果，将为改善各类癌症的预防，检测和治疗铺平道路。
正如Pan-Cancer Initiative协办方Josh Stuart--加州大学圣克鲁斯分校生物分子工程教授所说：“了解一种癌症如何与另一种形式的疾病相关，可能具有真正的临床意义。”他也认为，”在某些情况下，我们可以借鉴已知疾病的临床实践，并将其应用于治疗方案不明确的癌症。“
从分子角度看，癌症也为已被批准用于其他具有癌症分子特征的疾病的药物开辟了道路。其中一个例子是在类风湿性关节炎中被激活的JAK / Stat分子途径。研究人员发现，这个通路在一些新认定的肿瘤组中上调。
PanCancer Atlas论文
三个PanCancer Atlas论文集中的每一个都是由热点或综述和论文引入的。在门户的登录页上有明确的链接和相关文章。
第一篇综述介绍了“cell-of-origin patterns”这一类别，概述了研究人员如何通过基因表达，染色体异常和DNA改变使“molecular clustering”形成肿瘤群。它表明这些发现将使不同类型的癌症得到更具体的治疗。
第二篇综述介绍了“oncogenic processes” 种类，并认为这些发现将有助于研究人员确定他们应该选择哪些免疫疗法和相应治疗方案的优先顺序。
除了给出一个广泛的总结，该论文还描述了癌症发展中三个关键过程的鉴定：①遗传和获得性突变; ②肿瘤基因组和表观基因组如何影响基因和蛋白质的表达; ③肿瘤细胞与免疫系统之间的相互作用。
第三篇综述整理了“signaling pathways”的类型，并总结了调节细胞周期，细胞生长和细胞死亡的信号通路中基因组改变的发现。这篇论文强调了这些过程对于不同癌症的相似性和差异性，并表明这些发现将有助于个性化用药，还可以在联合治疗中开发新的治疗方法。
“这个项目为癌症研究人员提供了人类前所未有的途径去了解肿瘤发生，发展以及从何而来等重要信息，从而优化临床试验和未来的治疗方案。”
——弗朗西斯科林斯博士
参考文献
Catharine Paddock et.al Why does cancer arise? Landmark study provides unique insight. (2018)
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