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类风湿性关节炎是一种全身性结缔组织疾病，既累及关节，也累及关节外组织：
1.关节病理：
(1)滑膜：急性关节炎早期滑膜增厚，充血和水肿，绒毛增生，血管翳(肉芽组织)从关节软骨边缘开始覆盖关节软骨，并腐蚀骨质，滑液增多、稀薄、混浊，晚期血管翳机化，形成厚的纤维组织，导致关节纤维性强直。显微镜下可见类纤维变性.电镜下可见A型壁细胞增大，Golgi内网结构变小，线粒体异常，分解微粒增大和破碎，以及许多致密颗粒(残余的小体)，显示酸性磷酸酶的活动性和被分解微粒酶不全消化的一些吞噬物质.
(2)关节软骨：被多种酶(胶原酶，蛋白酶、弹性蛋白酶)腐蚀变粗糙，变薄和局限性坏死，与骨关节相反，首先侵犯不负重部分，并可继发增生性改变.
(3)关节囊：在晚期由于水肿和纤维化而增厚.
(4)近关节骨质：早期骨质疏松，晚期髓腔内肉芽组织形成的纤维组织侵入关节，和关节内机化的血管翳，导致纤维性强直.在典型的类风湿性关节炎，新骨形成和骨小梁穿过关节相当少见.
2.关节外病变：
(1)皮下结节：典型病例中有20～30%.多在受压部位，如肘部.大小不一，可聚集在一起.结节由纤维组织构成，又可分为三区：中央区为类纤维变性和坏死;中间区为成纤维细胞，呈放射栅栏状;外围区为纤维组织和小圆细胞浸润.陈旧结节可完全坏死、液化或形成空洞.结节可致骨膜炎，少有骨腐蚀.
(2)肌肉病变：肌肉萎缩多见，与发炎关节有关的肌肉更明显.病变有淋巴细胞结节，继发动脉炎的坏死，肌电图呈肌病改变.
(3)神经病变：偶发神经变性病.
(4)肌腱病变：可有增粗，类纤维变性和纤维化，如板机指或变性的伸指肌腱摩擦断裂.
(5)滑囊：偶发于骨凸部，有厚壁，与关节滑膜的改变相似.
(6)血管病变：有五型，为内膜增殖、血管周围圆细胞聚集无坏死、全动脉炎无坏死.急性坏死性动脉炎、毛细血管炎和小静脉炎.
(7)心脏病变：临床少见，尸检并不少见.病变可发生在心肌、心内膜或心包.由于类风湿性关节炎所致的临床冠状动脉栓塞罕见.
(8)肺病变：可有胸腔积液、肺内孤立性类风湿性结节，弥漫性肺间质纤维变性(呈蜂窝状)等。
(9)淋巴结：因滤泡增生和窦粘膜炎所致的淋巴结肿大常见(30%).
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