胃食管反流病临床表现十分复杂，涉及脏器众多，许多时候泛酸、烧心等典型症状不明显；另一方面，西方国家对此病的认识较早，国内长期以来对此病认识不足，近些年医学界才开始重视胃食管反流病的研究。
一项统计表明，可能被误诊的胃食管反流病多达38种，是临床上最容易被误诊的疾病之一。
下面列举一些常见的容易误诊的疾病，其实它们可能都是反流惹的祸。
1.慢性咳嗽胃的酸性内容物经食道上端刺激咽喉，甚至进入气管和肺部，导致咽痒、咳嗽。
对于无典型反流症状的慢性咳嗽患者，如有下列指征，应考虑胃食管反流病的可能性：①咳嗽与进食相关，如餐后咳嗽，或进食某种食物后咳嗽等；②咳嗽在入睡后数小时发作，凌晨或早起时咳嗽发作或加剧；③按常规治疗咳嗽效果不明显。
2.哮喘胃的酸性内容物经食道向上反流至咽喉部和气管，引起喉气管痉挛、收缩，进而造成气道狭窄或声门闭塞，表现为吸气困难、有窒息感，严重者会危及生命。
这种“哮喘”与通常所说的过敏性哮喘有很大不同，例如无明显的过敏原，长年发病，久治不愈，没有季节发作特点，主要以喉部痉挛为主，表现为吸气困难，容易半夜因憋气惊醒，有的伴有阵发性呛咳，或有泛酸、烧心、腹胀、食欲减退等症状。
此类哮喘应用激素和氨茶碱等治疗后反见加重，因为这些药物可降低食管下端括约肌压力而使反流症状加重。
对久治不愈的哮喘患者，必须考虑是否存在胃食管反流。
3.慢性咽炎咽位于食管的上端，长期反流刺激会导致咽部的慢性炎症，约30%的慢性咽炎与反流有关。
慢性咽炎表现为以下特点的，要考虑胃食管反流病的可能性：①咽部不适，或痛，或痒，或有干燥、灼热、烟熏及异物感等，晨起时发作或加重，可伴有刺激性咳嗽，用力咳出分泌物，甚或作呕；②症状在饱食或平卧后加重，或因饮食不当而诱发；③咽炎反复发作，常规用药无效，或即使有效，但停药即复发。
4.慢性鼻炎胃内容物反流至鼻腔，刺激鼻黏膜，引起慢性炎症，导致鼻黏膜对外界刺激特别敏感，产生防御性反射动作：打喷嚏及其他鼻炎症状。
反流引起的鼻炎和过敏性鼻炎很相似，但两者仍有本质区别：①前者没有明显季节性，而后者则可能有明显的季节性；②前者在清晨和睡醒时最明显，因为长时间卧位使胃内容物更容易反流到鼻部，而后者则容易在接触粉尘等过敏原后发作；③后者对环境的变化比较敏感，如冷热空气的交替。
5.胸痛、冠心病胃食管反流导致的胸痛与心绞痛的位置相近，所以容易被误诊为心脏病。
此外，食管与心脏的神经支配是一致的，当食管黏膜上皮感受器受刺激时，可引起心绞痛样胸痛。
长期胃食管反流也可能是诱发冠心病的重要因素，原因是酸性物质刺激神经反射，引起心脑血管痉挛，出现血压升高，心脏、脑部缺血及严重的痉挛甚至会引发心肌梗死。
6.睡眠障碍夜间反流使食道受到刺激，容易唤醒患者。还会表现出其他不同形式的睡眠障碍，如入睡难、睡眠浅、早醒等。
7.其他如肩背痛，表现为后背两肩胛骨之间不适或疼痛，在夜间入睡后一段时间发作或加重，或因饮食失宜而诱发；突发性耳鸣及听力下降等。
