女性体内有一条调节女性激素的轴，称为下丘脑-垂体一性腺轴。它正常运转，卵巢才可以正常排卵，雌孕激素才可以发生周期性变化。激素作用于子宫内膜，子宫内膜发生周期性的脱落和出血，从而出现了女性特有的月经，即“大姨妈”。
出血日为月经的第1天，两次月经的第1天的间隔时间称为一个月经周期。医生在问诊时提到的末次月经或最后一次月经，指的就是最后一次月经的第1天。如果你怀孕了，算预产期的时候，也可以根据最后一次月经的第1天来算。
正常的月经周期是21~35天，平均为28天。1个月经周期分为月经期、卵泡期和黄体期3个阶段：月经期是月经周期的第1~4天。每次月经的持续时间为经期，这是两个不同的概念。
卵泡期是卵泡生长的时期。平时做的排卵监测就是监测在这个时期卵泡发育的情况。正常情况下，例如某人的月经周期是28天，那么在月经周期的第10~12天就应该有一个优势卵泡，直径12~14mm，到第14天能长大至18~2mm，同时成熟的卵泡分泌大量雌二醇，促进排卵的激素也会升高。对于第一次做排卵监测的女性，医生会建议其查一下排卵前卵泡的雌二醇、促黄体生成素等，可初步判断这个卵泡的质量。
黄体期是排卵后到月经期的前1天。因为月经周期长短不同，所以女性的卵泡生长速度也不一样。卵泡成熟后开始排卵，进入黄体期。如果卵子没有受精，那么残留在卵巢中卵子周围的颗粒细胞等将形成黄体。黄体寿命约14天，排卵后第7天黄体功能最强，此时雌二醇和孕激素均达到高峰，然后逐渐下降，排卵后14天降至基础水平，同时月经来潮。很多女性问医生怎么算排卵期，黄体期的长度差不多是固定的，所有女性都一样，为12~16天，平均为14天，所以对于一个月经周期特别规律的女性，排卵期在下一次月经来潮的前14天。举个例子，一位女性的月经周期是30天，这次月经是5号来，下次月经大约是下月5号来，那排卵日从下月5号往前推14天，即本月21号。对于月经周期不规律的女性，一般排卵也不规律，所以医生无法给出准确的排卵日，只能建议她们通过做经阴道超声监测卵泡来确定排卵期。
排卵后同房，如果形成受精卵并顺利种植到子宫内膜，月经黄体就会转变为妊娠黄体，一直分泌黄体酮，给予胚胎黄体支持，直至孕10~12周，胎盘逐渐形成，取代妊娠黄体的支持作用。在促排卵周期中，部分促排卵药有溶黄体作用，使黄体萎缩无法为胚胎提供黄体支持，所以，在排卵后需要口服孕酮加强黄体支持。在试管婴儿周期中，也需要完全替代的黄体支持，一直到胎盘形成再逐渐减量。
除了性激素，月经还受其他许多激素如甲状腺激素、肾上腺激素及神经的调节。所以，环境的改变、心情的起伏、精神的变化都可能导致月经的改变。
