据说，“盘古”率其人民辟草莽，斩荆棘，驱虫蛇鸟兽，而立国于中土。
有一瑶民不慎脚部受伤溃烂，经久不愈，后在梦中得白发白须老翁指点，次日找回大黄等三味药外洗，不出数日竟全好了，此后，又以此药治好了许多同样的患者。
于是，群众都称他为“仙生”。由此可见，瑶族医药在原始时代已经开始萌芽。
身为炎帝后裔的瑶族先民在与某氏族的战争中惨遭失败，在生活条件极其困难的环境下，不断寻找能够防治疾病的天然药物和探索治疗的方法，并在长期与疾病的斗争中，积累了丰富的经验，代代相传，逐步形成了具有自己民族特色的一套医药原理。
整体观——三元和谐论
瑶医认为世界是一个整体，人生与天地之间，天地的各种因素都影响人的正常生活。如果人能适应天地的变化，就健康无病。
如果天地因素的变化超出了人的适应能力，或者人自身的变化不能适应天地的各种因素，人就会生病，这就是瑶医提出的“三元和谐论”。
生命观——气一万化论
瑶医学认为气是人生存的最根本的基础，是生命活动之主、之本、之母，人活的就是一口气，即生命之气，失去了这口气，生命就会终止。气的存在状态有弥散和聚台两种。
人体的组成物质都是由气化生的，人体各个器官的功能活动都是由气派生的，包括人的感觉、思维、情志等精神心理现象和皮毛、肌肉、筋骨、爪牙等运动，都是气运动的具体体现。
方法论——盈亏平衡论
瑶医认为人体内脏之间、人体内脏与外界环境之间，既对立又统一，从而维持相对盈亏平衡和正常的生理活动。
当这种动态盈亏平衡因外界或人体内部某些原因遭到破坏而又不能完全自行调节得以恢复时，人体就会发生疾病。
盈亏平衡理论提示机体是一个统一的整体，机体自身各脏腑之间的盈亏应平衡，机体与周围环境也应相互平衡。
生死观——心肾生死论
人的生理病理最根本的就是一个生和死的问题，生由肾主，肾有病则人体或生长发育不好，或不生育；死由心主，不管疾病如何严重，只要未伤到心神人就不死。
经脉论——诸病入脉论
脉，指筋脉，瑶医所认识的筋脉与中医的经络有相似之处，但理论远不如中医的“经络学说”完备。
瑶医学认为筋脉可运行“气”和其他生命物质，并能发挥沟通人体内外、联系各个器官功能活动的作用，人体内外无处不有筋脉。
无论何种疾病，不论从外而病，还是从内而病，病邪都是通过全身的筋脉播散、传变，从而侵犯人体各处。
他们的医学理论和其他医学的理论又有什么不同之处呢？
