说起艾灸和针灸很多人都认为是同一种中医疗法，都是通过刺激穴位达到疏通经络的效果，也有人认为艾灸是针灸的一个分支，但事实并非如此，《灵枢.官能》中说：“针所不为，灸之所宜。”《医学入门》中曰：“凡病药之不及，针之不到，有必要灸之。”所以艾灸和针灸还是有区别的。
工具上的区别：从字面上不难看出艾灸和针灸的区别，艾灸疗法的原料是艾绒、艾柱、艾条等，艾灸的工具也有王太医随身灸、艾灸棒等工具辅助施灸，点燃艾柱熏烤人体的穴位使艾热渗透体内达到温经散寒、祛湿补虚的效果；针灸所选择的工具就简单的多了就靠着中医手中的银针刺激人体穴位达到疏通经络的效果，在中医里叫做“痛则不通、通则不通”。
治疗原理上的区别：普通的针灸讲的是纯物理疗法，单纯的靠针刺穴位达到治病养生的目的，没有任何药物。而艾灸则是在针灸的基础上加上了艾叶的功效，可以说是物理疗法和药物疗法的搭配疗法，因此在治疗效果上艾灸的疗效要好于针灸。而且针灸主泄，艾灸主补，对于身体虚弱的人来说还是适合艾灸疗法。
治疗过程的区别：针刺穴位的针灸过程中，通过“捻转提插”刺激穴位，会让人有酸麻胀痛的感觉，同时针灸一般要专业人员施灸；而艾灸的离穴不离经让艾灸简单很多，自己即可操作，而且艾灸是通过熏烤穴位不会直接刺激皮肤，加上艾叶性温的特点，艾灸过程中不会让人产生不适感。
治疗副作用的区别：针灸对穴位的精确度要求较高，如果操作不当会有一定的副作用，而且银针直接接触皮肤和血液，会出现传播感染的情况；艾灸对穴位的要求没那么专业，一般的疼痛取“阿是穴”即可，再加上艾灸的面积较大在舒经络、通肠道、止咳平喘、祛邪补虚取穴时要简单很多。
