乙肝患者在结束抗病毒药物治疗后还要经常到医院去检查，监测肝功能、HBV DNA和其他与乙型肝炎疾病进展有关的指标，防止肝炎复发或乙肝病毒再活动。
停药后肝炎复发的实质是病毒仍未被彻底抑制，患者体内的乙肝病毒并非真正处于非活动状态，停药后失去了药物的抑制，病毒很快再度复制，HBV DNA反弹，也就是病毒学复发。E抗原血清学转换的患者常常会出现E抗原的逆转，随后出现ALT升高，即肝炎的临床复发。
因此，停药后肝炎复发一般在停药3个月内即可发生HBV DNA反弹，6个月时达到高峰，并出现ALT升高。大多数肝炎复发在停药后1年以内发生。这种停药后肝炎复发起病往往较急，有10%的患者在HBV DNA反弹后ALT骤升至>10倍的正常值的上限，甚至出现黄疸，发生肝衰竭。
因此，在停药后应该每个月进行肝功能和HBV DNA的检测，停药后6个月仍未复发的患者，可以逐渐的延长复查时间。
停药后的“乙肝病毒再活动”是治疗后病毒确实被彻底抑制，进入非活动状态，停药后达到了至少1年以上保持持续病毒学应答，但病毒发生了前C区变异，逃逸了免疫系统的抑制，再度复制并引起肝病，也就是进入乙肝病毒感染自然史的第4期。乙肝病毒再活动起病较缓慢，HBV DNA逐渐升高，ALT轻至中度升高。
停药后的随访除了监测乙肝复发或乙肝病毒再活动外，还需要监测肝细胞癌的发生。一些患者，尤其是肝硬化患者，即使表面抗原消失了，仍有可能发生肝细胞癌，因此，仍然需要定期监测，长期的随访。
